Alors que le changement climatique redéfinit les conditions de survie et de déplacement des agents pathogènes, la résistance aux antimicrobiens (RAM) n'est plus seulement une question d'utilisation d'antibiotiques. Un nouvel éditorial publié dans Animal Diseases place les maladies animales au cœur de ce risque émergent, arguant que le réchauffement, les inondations, l'agriculture intensive, les eaux usées et les systèmes alimentaires peuvent relier les bactéries résistantes entre les animaux, les environnements et les humains. Utilisant Salmonella non typhoïdique comme sentinelle, l'article propose un cadre One Health pour comprendre comment les pressions climatiques pourraient affaiblir les barrières écologiques qui aidaient autrefois à contenir la RAM.
Publié le 29 juin 2026 dans Animal Diseases (DOI : 10.1186/s44149-026-00255-5), l'éditorial intitulé « Climate change and AMR in animal diseases: a one health perspective on emerging global risks » provient de l'Institut d'études avancées de Hangzhou, Université de l'Académie chinoise des sciences. Plutôt que de présenter le changement climatique et la RAM comme des crises parallèles, l'éditorial les relie à travers l'écologie des maladies animales et le cadre One Health. Il est en outre soutenu par un article de recherche connexe publié dans The Lancet Planetary Health en 2026, qui a examiné comment le changement climatique est associé à la propagation mondiale des gènes de résistance aux antimicrobiens (ARG) dans Salmonella.
La contribution centrale de l'éditorial est une carte des risques pratique. Il décrit un nexus de convergence One Health–climat dans lequel Salmonella non typhoïdique et les ARG circulent parmi les hôpitaux, l'agriculture intensive, les systèmes de traitement des eaux usées, les bassins versants, les fermes, les produits alimentaires et les environnements de vente au détail. Le changement climatique peut intensifier cette boucle par deux voies immédiates : les effets physiologiques liés à la chaleur sur les bactéries et le mouvement des eaux contaminées dû aux conditions météorologiques. L'article soulève en outre la possibilité que le stress climatique puisse influencer l'adaptation des agents pathogènes dans les systèmes de production, bien qu'il traite cela comme une hypothèse nécessitant une validation plus large.
L'étude complémentaire de The Lancet Planetary Health fournit la base empirique de cet avertissement. Les chercheurs ont analysé 488 232 génomes de Salmonella provenant de 139 pays ou régions entre 1940 et 2023 et ont constaté que l'abondance moyenne mondiale des ARG dans Salmonella a augmenté de 38 %. Le changement climatique était associé à une augmentation de 10 % de l'abondance des ARG, avec des augmentations dans 82 des 100 pays analysés. La modélisation future a suggéré que les voies à faibles émissions, combinées à une gestion renforcée des antibiotiques, pourraient réduire les ARG de Salmonella de 24 % par rapport aux scénarios à fortes émissions. Dans l'éditorial, ces résultats soutiennent une réponse en trois parties : une surveillance génomique informée sur le climat, des interventions ciblées sur la santé animale et des politiques intersectorielles intégrées qui peuvent faire passer le contrôle de la RAM de programmes isolés à une prévention coordonnée à travers les systèmes climatiques, d'élevage, environnementaux et de santé.
Les auteurs ont déclaré que ce travail appelle à passer de la réaction aux infections résistantes à l'anticipation des endroits où les risques de RAM pourraient s'intensifier. Ils ont indiqué que la gestion des antimicrobiens reste le fondement du contrôle de la RAM, mais qu'elle devrait être associée à des données climatiques, à la surveillance de la santé animale et à la surveillance environnementale. Selon eux, One Health devrait guider les décisions pratiques – depuis l'endroit où les génomes sont séquencés jusqu'à la préparation des fermes, des systèmes d'eaux usées et des programmes de sécurité alimentaire aux extrêmes climatiques. L'objectif est de protéger l'efficacité des antimicrobiens avant que les pressions climatiques n'élargissent les lacunes existantes.
Le cadre dirigé par l'éditorial offre des points d'entrée clairs pour la politique et la pratique. Les services vétérinaires peuvent utiliser les signaux climatiques pour identifier les périodes à haut risque d'épidémies de maladies animales et d'infections résistantes. Les agences de santé publique peuvent relier la surveillance génomique aux données sur les précipitations, la température, les eaux usées, le bétail et l'utilisation d'antimicrobiens. Les systèmes de sécurité alimentaire peuvent renforcer la surveillance après les inondations, les vagues de chaleur et autres perturbations qui pourraient mobiliser des bactéries résistantes. Pour les pays à revenu faible et intermédiaire, l'article souligne également la nécessité d'un séquençage abordable, de personnel formé et d'accords équitables de partage des données. Plus important encore, le travail suggère que l'atténuation du changement climatique, la santé animale, l'assainissement et la gestion des antibiotiques devraient être traités comme un investissement interconnecté dans la sécurité sanitaire mondiale, en particulier dans les régions où la vulnérabilité climatique et le fardeau de la RAM se chevauchent.
